时光飞逝，转眼又是一年的时间过去，宁次顺利的成为二年级学生，凭借着秋道一族的秘术，宁次体内查克拉已经接近260卡，因为秘术使用的越发熟练，且胃部功能也得到加强，食量也有所提升，查克拉的提升速度比预期的要快一些，现在的宁次拥有一般中忍的查克拉储存量和成长到精英上忍的查克拉超控，估计对上精英中忍应该有得一拼，因为宁次压根没实战过，估计输面还是比较大的。还好生在和平年代，不用那么早的面对血与火。
除了查克拉的增长，这一年，宁次已经将忍者学校所有课程学习完毕，同时还开展了宁次另外一个庞大的计划：“神农百科”计划，宁次将自己超越常人的感知和堪称科研神器的白眼利用起来，用以编制一本史上最全的材料百科全书，书中包含植物、动物、矿物、微生物等所发现的一切事物的特性和简介。
“神农百科”将是宁次进击科研的基石，该项目主要分为三个阶段：
第一阶段为归纳和总结：该阶段宁次将收集市面上所有已经被记载和总结归类的事物，将其重新按照自己的方式进行分类、归纳和总结；
第二阶段为审核与发掘：在完成归纳和总结后，宁次将对已经在编的品种进行重新审核，判断其性质是否正确和全面，对不正确或有遗漏的进行更正；
第三阶段为新增原始品种：完成前两阶段后，将对未被发掘的物质，进行深入的研究，得出其性质和用途后编入“神农百科”；
为了“神农百科”项目顺利推进，半年前宁次查克拉有所小成之时，便每天安排一个影分身专职负责推进“神农百科”的编制。目前已经小有所成，完成了近两千种现有物质的归类和总结。
为了少一些麻烦，这一年中宁次在学校也小露了一手，顺利的成为年级首席生，老师对其也少了很多管教，多了些宽容，同级生在被教育了几次后也鲜少有人来自讨没趣。之后影分身便全权代替了宁次上学，宁次将更多时间放在自我锻炼。
在超强查克拉控制能力带动下，宁次的柔拳也进步神速，全身720个穴道，除了哪些死穴和极其难开的外，宁次都已经开启，查克拉流转全身，一阵通透。
而穴位的开启，带来的好处就是，日向一族的绝对防御“回天”顺利学会，同时还能在自己穴位中射出查克拉子弹，威力不是特别强，但是胜在诡异和多边，有点像君麻吕的指骨弹。一个是发射凝练的查克拉，一个是指骨。
在柔拳进步神速的同时，宁次也开始了钢拳的修行，宁次可不像日向家族一些族人一样妄自尊大，认为柔拳天下第一，其他的体术都是渣滓。
迈特凯那一脚差点踢出大结局，这可不是一般的厉害，而八门遁甲对宁次来说同样具有很高的吸引力。